Genómica de plantas · Bioinformática

Análisis genómicos para tu laboratorio, de principio a fin.

Del dato crudo a las figuras del artículo: ensamblaje, anotación, transcriptómica, metilación y metabarcoding para sistemas vegetales y patógenos. Una sola persona, responsable de todo el análisis.

7 PUBLICACIONES · COLABORACIONES CON GRUPOS UNIVERSITARIOS · PYTHON / R / HPC

analysis_console
COV
REF
5mC
cobertura · referencia · metilación

Cómo fluye el pipeline

Entran lecturas crudas. Salen resultados publicables.

Lecturas crudas
Illumina · PacBio · Nanopore
Ensamblaje
contiguo, pulido
Anotación
estructural + funcional
Análisis
expresión · metilación
Interpretación
genes candidatos, biología
Manuscrito
figuras, métodos, código

Análisis con estándar académico

Métodos elegidos para tu biología y defendibles ante revisores.

Resultados, no solo scripts

Hallazgos interpretados, figuras y métodos documentados.

La mirada de un especialista

Genomas vegetales, oomicetos e interacciones planta-microbio.

Pablo Vargas Mejía

A cargo de

Pablo Vargas Mejía

Investigador en genómica de plantas y bioinformática, especializado en patología molecular vegetal. Investigación doctoral en la UNAM sobre la epigenómica de Phytophthora capsici, con colaboraciones de investigación en patología vegetal y genómica.

Sobre mí

¿Tienes datos que necesitan manos expertas?

Cuéntame sobre tu organismo, tus datos y tus tiempos. Te responderé si puedo ayudar y cómo definiríamos el alcance. Sin compromiso.